Primera presentación

Seminarista:  Heli Magali Garcia Alvarez - Becaria doctoral; UNSAM

Título: Mejora en la predicción de unión de péptidos a CMH de clase I integrando datos provenientes de experimentos de RNA-Seq

Resumen: La presentación de antígenos por el Complejo Mayor de Histocompatibilidad (o CMH) de clase I es un proceso crucial para la inmunidad adaptativa. Los complejos péptido:CMH-I presentes en la superficie celular se unen a los linfocitos T CD8 + citotóxicos permitiendo erradicar a aquella células infectadas por virus o parásitos, o también a células cancerosas. El camino de procesamiento y presentación antigénica de tipo I consiste en diferentes pasos, muchos de los cuales pueden ser predichos por métodos computacionales. Sin embargo, la mayoría de los métodos disponibles actualmente no tienen en cuenta la abundancia relativa de las proteínas en la célula, o de los transcriptos que dan origen a las mismas, a la hora de predecir qué péptidos serán los presentados por la vía de clase I. En esta charla les hablaré de un nuevo método, desarrollado recientemente por nuestro laboratorio, que integra datos provenientes de experimentos de RNA-Seq con el objetivo de mejorar las predicciones de unión de péptidos a CMH-I. Este método se propone como un refinamiento al predictor NetMHCpan-4.1, basado en redes neuronales, que constituye el estado del arte en este campo de estudio.

Segunda presentación

Seminarista:  Catalina Blazquez

Título: Aplicación de herramientas inmunoinformaticas en la identificación de epitopes vacunales de EBV

Resumen:  El virus de EBV es el agente etiológico de la mononucleosis infecciosa y se asocia también a patologías malignas de origen linfoide y epitelial. Se han propuesto diferentes candidatos vacunales, como la glicoproteína gp350 y gp42, sin embargo aún no se dispone de una vacuna eficaz contra EBV. Las glicoproteínas gp350 y gp42, así como también gH, gL y gB, se localizan en la envoltura viral y están implicadas en el ingreso del virus al linfocito B humano. En este trabajo, se propone buscar posibles epitopes utilizando distintas herramientas inmunoinformaticas, para finalmente colaborar en el diseño de una vacuna recombinante dirigida contra estas glicoproteínas viral.